研究助成
2021年度 ライフサイエンス研究助成
ゲノムの構造機能相関の解明を目指したHi-CO法の開発
| 研究題目 | ゲノムの構造機能相関の解明を目指したHi-CO法の開発 |
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| 年度/助成プログラム | 2021年度 ライフサイエンス研究助成 |
| 所属 | 京都大学 高等研究院 物質ー細胞統合システム拠点 |
| 氏名 | 大野 雅恵 |
| キーワード | ヌクレオソーム / ゲノム3次元構造 |
| 研究結果概要 | 細胞内でゲノムは、まずヒストンに結合してヌクレオソーム構造をとり、さらにヌクレオソーム同士が積み重なった高次構造をとっている。これまでに申請者は、このゲノム構造の最小単位であるヌクレオソームの分解能でゲノム構造を決定するHi-CO法を開発した。これまでの対象は出芽酵母であったが、本助成により、ヒト細胞へと拡張することに成功した。両者で比較した結果、出芽酵母では、プロモーター領域のヌクレオソームの集合性が低く、遺伝子のORF領域のヌクレオソームの集合性が高かった。一方、ヒト細胞では、プロモーター領域においてヌクレオソームが集合し、さらに他の遺伝子のプロモーター領域とループ構造を形成していた。出芽酵母のゲノム構造の特徴は、転写開始に必要なRNAポリメラーゼをオープンなプロモーター領域に結合させることで、ORF領域からの異常な転写を防ぎ転写開始を制御する役割をもつことが考えられる。ヒト細胞におけるプロモーター領域でのヌクレオソームの集合構造が転写制御に与える役割についてはまだ不明であるが、RNAポリメラーゼやエピジェネティクス因子と、ヌクレオソームの集合性について解析を進めている。 |
| 公表論文 | Hi-CO: 3D genome structure analysis with nucleosome resolution, Nature Protocols, 16 (7), 3439–3469, 2021 |