研究助成
2023年度 生命科学研究助成
マウス初期発生過程で構築されるゲノム高次構造とそれに関わるlncRNAの同定
| 研究題目 | マウス初期発生過程で構築されるゲノム高次構造とそれに関わるlncRNAの同定 |
|---|---|
| 年度/助成プログラム | 2023年度 生命科学研究助成 |
| 所属 | 東京大学 生命科学ネットワーク（大学院総合文化研究科・広域科学専攻・大杉研究室） |
| 氏名 | 冨川 順子 |
| キーワード | lncRNA / 全能性 / 2CLC |
| 研究結果概要 | 申請者は、マウス2細胞期胚の核内で複数の染色体領域が染色体間相互作用を介してハブ状に集積していることを見出した。この構造は発生が進んだ胚では形成されておらず、分化全能性への寄与が考えられた。このようなクロマチン構造構築に関わる因子として、申請者はlncRNAに注目した。そこで、CRISPRi法を用いて2細胞期胚特異的な染色体間相互作用を介した高次構造形成に関わるlncRNAのゲノムワイドなスクリーニングを試みた。2CLCの出現が確認できるように、2C特異的プロモーターにtdTomatoを結合させたトランスジェニックES細胞株を用いマルチガイドCRISPRiにより標的とする複数のlncRNA遺伝子の発現を抑制させ、24時間培養後、2CLCの出現頻度をFACSにより検証した。その結果、2CLCの出現率は顕著に上昇した。回収した2CLCおよびES細胞のRNA-seqの結果、いずれも機能未知のlncRNAを複数同定した。現在、発見したlncRNAに対するRNAiを行い、FACSにより2CLCの出現変動を検証し、ES細胞から2CLCへの脱分化に寄与しているlncRNAを特定したいと考えている。 |
| 公表論文 |